高性價(jià)比

    在結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域清華大學(xué)走在了科技的最前沿。清華生命學(xué)院決定采用戴爾高性能計(jì)算群集方案（HPCC-High Performance Computing Cluster）為結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究提供一個(gè)更為高效的研究平臺(tái)，創(chuàng)造更為良好的研究環(huán)境。

    2010年初，清華生命學(xué)院經(jīng)過廣泛考察、慎重選型、反復(fù)測(cè)算最終決定引進(jìn)1套大規(guī)模的44計(jì)算節(jié)點(diǎn)的戴爾HPCC系統(tǒng)，該系統(tǒng)由”計(jì)算節(jié)點(diǎn)“、”管理節(jié)點(diǎn)I/O節(jié)點(diǎn)“、”存儲(chǔ)后臺(tái)“”計(jì)算與管理網(wǎng)絡(luò)“4個(gè)主要部分構(gòu)成：其中HPCC系統(tǒng)的計(jì)算節(jié)點(diǎn)由11臺(tái)戴爾PowerEdgeTM C6100機(jī)架式服務(wù)器擔(dān)任，每臺(tái)C6100機(jī)箱內(nèi)配置有4臺(tái)刀片服務(wù)器，每臺(tái)刀片配置了兩顆2.4GHz英特爾R至強(qiáng)R5645 六核處理器、24GB內(nèi)存（6x4GB）、1塊3.5英寸7.2K RPM SATAII硬盤，2塊Broadcom 10/100/1000Mbps 自適應(yīng)以太網(wǎng)卡（支持TOE offload 引擎技術(shù)）

    ”戴爾C6100服務(wù)器+Infiniband網(wǎng)絡(luò)“為核心的HPCC系統(tǒng)于2010年3月完成組裝和調(diào)試，目前已運(yùn)行了1年多的時(shí)間，整體運(yùn)行狀況非常平穩(wěn)。清華大學(xué)生命學(xué)院崔野老師是這套HPCC系統(tǒng)的主要管理者，他對(duì)系統(tǒng)的表現(xiàn)給予了充分的肯定。崔野老師介紹說(shuō)：”目前，生命學(xué)院結(jié)構(gòu)生物研究的主要計(jì)算任務(wù)均由這套HPCC系統(tǒng)來(lái)完成。該系統(tǒng)的上線，有效地保障了我們?cè)诖蠓肿友芯糠矫娴挠?jì)算效率，與傳統(tǒng)的機(jī)架式服務(wù)器組成的HPCC相比，采用戴爾C6100服務(wù)器我們可以節(jié)省50%的空間，節(jié)省30%以上的電力消耗，這可以讓我們的運(yùn)營(yíng)成本得到有效的控制。“

    崔野老師接著介紹說(shuō)："從實(shí)際效果看，戴爾HPCC運(yùn)行穩(wěn)定，數(shù)據(jù)處理速度很快，完全能夠滿足我們開展大規(guī)模科學(xué)計(jì)算的要求。我們當(dāng)前工作的重點(diǎn)是利用HPCC系統(tǒng)進(jìn)行大分子蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的研究計(jì)算，這種研究時(shí)效性強(qiáng)，緊迫性高，任務(wù)繁重，要求HPCC系統(tǒng)必須具有超強(qiáng)的計(jì)算能力，而戴爾HPCC的浮點(diǎn)運(yùn)算速度峰值可以達(dá)到每秒五萬(wàn)億次（5TFLOPS），我們對(duì)這樣的計(jì)算能力感到十分滿意。此外從發(fā)展的角度來(lái)看，戴爾HPCC系統(tǒng)的高效性為日后結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究工作的深入打下了非常扎實(shí)的基礎(chǔ)。"